药物设计学
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发布时间:2009-03-26  浏览次数:

 

药物设计中常用数据库的网址、内容和说明

类型

名称

网址

 

 

 

 

 

药学信息数据库

PharmaProjects

http://pharmaprojects.com/terms.htm

新药开发动态的商业资源

Ensemble

http://ensemble.prous.com/ensemblesql/ensemblesql.asp

介绍处于不同研究阶段的活性化合物

Daily Drug News

http://www.dailydrugnews.com/ess/today.com/ess/today.cfm

每日药物新闻

Scrip

http://www.pjbpubs.com/scrip/index.htm

世界制药信息

Pharm. Market Letter

http://www.marketletter.com/pharmamarketletter.htm

药物市场快报

Thomson PharmaSM

http://www.thomsonScientific.com

全球综合性药学信息

CRC理化手册

http://www.hbcpnetbase.com

综合化学辞典

http://ccd.chemnetbase.com

药物化学大全

http://www.mdli.com/cgi/dynamic/product.html

马丁代尔药典

http://www.medicinescomplete.com/mc/index.htm

ScienceDirect

http://www.sciencedirect.com/science/journals

基于Web的电子期刊全文检索系统

Wiley InterScience

http://www3.interscience.wiley.com

Springer Link

http://www.springerlink.com/home/main.mpx

ACS

http://pubs.acs.org/about.html

PubMed

http://www.pubmed.gov

全球最大的生物医学文摘

Enbase

http://info.embase.com/embase_com/about/index.shtml

荷兰医学文摘

国际药学文摘

http://scientific.thomson.com/products/ipa

 

化学数据库

MDL数据库

http://www.mdli.com/

MDL公司提供CMC药物分子数据库(8165个化合物)和MDDR活性化合物数据库(118675个化合物),以及ACD3DACDSC数据库(化合物供应商产品目录,后者含超过200万个化合物,可用于虚拟筛选)。

Beilstein Crossfire

http://www.crossfirebeilstein.com/index.shtml

最完整的有机化学数字资源

CA 光盘

http://www.cas.org/CAS100/index.html

SciFinder Scholar

http://www.cas.org/SciFinder/newfeatures.html

每天更新的在线数据库,专利文献是特色

NCI数据库

http://dtp.nci.nih.gov/

美国国家癌症研究所(NCI)基于不同靶标筛选过的化合物目录约50万个,其中一半为免费,含相关活性数据,以化学结构及相关信息进行检索。

PubChem

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

小分子生物活性数据

化合物检索

(中文)

http://www.chemfinder.cn/

采用常用物质名称、CAS编号或分子量,分类检索如下数据库:常用物质性质数据库;危险物品及其毒性数据库;热力学数据库;光谱能谱数据库;天然药物数据库

ChemFinder

http://chemfinder.cambridgesoft.com/

可采用化合物名称、CAS编号、分子式或者分子量分类检索多个化合物数据库,包括反应数据库。有些数据库检索是收费的。

ZINC

http://zinc.docking.org/

免费的可供虚拟筛选使用的商用化合物数据库,含有超过460万个化合物的三维结构

Drug Bank

http://redpoll.pharmacy.ualberta.ca/drugbank/

药物与相关靶标信息

eMolecules

http://www.emolecules.com/

集合化学品供应商提供的分子结构,以文本或结构式方式检索化合物结构及供应商信息,还可按类型检索。

ASINEX

http://www.asinex.com/about.html

组合化学样品库

synopsys

http://www.synopsys.co.uk/

提供药物和精细化合物服务

SPORE

http://www.fiz-chemie.de/katalog/organic/

组合化学和反应数据库

 

生物学数据库

 

 

PDB

http://www.rcsb.org/pdb/

X-射线、NMR等实验方法测定的生物大分子三维结构数据库,主要为蛋白质及其复合物结构,也包括核酸等结构。

SCOP

http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/

蛋白质结构分类

CATH

http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath_new/index.html

蛋白质结构分类数据库

GenBank

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html

DNA一级序列数据库(美国),提供5700多万各蛋白质的核酸序列

EMBL

http://ebi.ac.uk/embl/index.html

核苷酸序列数据库,包含序列名称、物种、序列长度、启动子、分类以及核酸序列(德国/英国)

DDBJ

http://www.ddbj.nig.ac.jp/

DNA数据库(日本)

SWISS-PROT

http://www.expasy.org/sprot/

包含了超过12万个蛋白质序列,4500多万个氨基酸。此外还提动了蛋白质功能等具有很高价值的注释信息

PIR

http://pir.georgetown.edu/

目前最大的公共蛋白质序列库

 

KDBI

http://bioinf.xmu.edu.cn/databases/kdbi/search.php

分子相互作用动力学数据库

 

TTD

http://xin.cz3.nus.edu.sg/group/cjttd/TTD_ns.asp

药物靶点数据库

 

DART

http://xin.cz3.nus.edu.sg/group/drt/dart.asp

副作用相关蛋白数据库